Впервые воротная башня Гостиного двора упоминается в документах за 1686 год. Тогда Гостиный двор в Новгороде появился в рамках крупных строительных работ, проводимых по приказу Петра I и охвативших весь город. Проект башни составил «каменных дел подмастерье» Семён Ефимов, от того комплекса сохранились только аркада Гостиного двора и Воротная башня.
С 1857 года в Воротной башне располагалось Новгородское приходское (позднее — высшее начальное) училище. В 1992 году постройка была включена в список Всемирного наследия ЮНЕСКО. Сейчас там развёрнута экспозиция «Христианские древности. Художественный металл XI–XIX вв.». Она открыта с четверга по понедельник с 10:00 до 18:00, первый понедельник месяца считается санитарным днём. Со смотровой площадки башни открывается хороший вид на Великий Новгород.