Свято-Серафимовская церковь была построена на пожертвования горожан в 1903 году. Архитектор Алексей Салько спроектировал деревянный храм, обложенный кирпичом. Он также является автором расположенных в Саратове Покровского собора, Первого городского Александро-Мариинского реального училища и здания Управления Рязано-Уральской железной дороги.
Церковь была освящена 28 декабря 1903 года и имела один престол — во имя преподобного Серафима Саровского. При ней были открыты приют для мальчиков и церковно-приходская школа. В 1935 году церковь закрыли, в помещении было создано общежитие института «Микроб».
В ноябре 1989 года верующие не допустили сноса Свято-Серафимовской церкви, которая спустя год была возвращена епархии. Теперь здесь устроили ещё один престол — в честь Серафимо-Дивеевской иконы Божией Матери «Умиление». С апреля 2012 года в здании проводятся масштабные работы по реконструкции. К храму приписаны часовни, расположенные на железнодорожном вокзале и на Воскресенском кладбище.
