9 сентября 2004 года в центре Саранска заложили капсулу с мощами и «закладной грамотой» на месте будущего храма. Кафедральный собор святого праведного воина Феодора Ушакова был торжественно освящён 6 августа 2006 года. На четырёх звонницах расположены 12 колоколов, отлитых в городе Тутаеве Ярославской области.
Авторами проекта церкви стали архитекторы Сергей Ходнев, Лариса Кирдяшова и Владимир Бродовский. В цоколе здания находятся крестильная церковь Преображения Господня, баптистерий, просфорная, классы для воскресной школы и другие помещения. В галерее нижнего этажа имеется выставка, посвященная истории строительства храма.