В 1935-1937 годах в Тойохаре (ныне Южно-Сахалинск), столице губернаторства Карафуто, построили здание для исторического музея. Средства на его возведение пожертвовали местные жители. Автором проекта в традиционном японском стиле «тэйкан-дзукури» — «императорская корона» — стал архитектор Ёсио Кайдзука.
В музее были выставлены коллекции по зоологии, палеонтологии, ботанике, этнографии коренных народов Сахалина и Курильских островов. Музей занимался исследовательской деятельностью, публиковал научные труды.
После освобождения островов от японских захватчиков некоторое время японские и советские музейщики работали бок о бок. В 1946 году в здании открылся советский Областной краеведческий музей. В настоящее время здесь хранится свыше 220 тысяч экспонатов, рассказывающих об истории, культуре и природе Сахалинской области.
