Это здание было построено для нужд Саратовской семинарии, которая переехала сюда в 1885 году. Это учреждение было открыто при епископе Моисее (Богданове-Платонове) в 1830 году. Тогда семинария в основном специализировалась на миссионерской деятельности и противодействию расколу, который был силён в Саратовской губернии.
В годы первой русской революции семинария стала одним из оплотов «семинарного движения», суть которого заключалась в радикальных изменениях в духовной школе. Несколько аудиторий во время Первой мировой войны заняли воинские части, мешавшие организовать учебный процесс. В сентябре 1918 года Саратовскую семинарию закрыли.
В 1947-1961 годах учреждение осуществляло учебную деятельность, после её воспитанников распределили в Ленинградскую и Московскую духовные семинарии. В 1992 году Саратовская семинария возобновила свою работу, в 2013 году переехала в историческое здание на улице Мичурина.
