Покровский собор был построен в Саратове в 1876-1883 годах по проекту епархиального архитектора Алексея Марковича Салько. Внутренняя отделка церкви продолжалась до начала 1885 года, росписью и созданием икон занимался художник-академик Лев Игорев.
20 января 1885 года Покровский храм освятили, его правый придел был посвящён Казанской иконе Божией Матери, левый — Пресвятой Живоначальной Троице. Строительство колокольни началось в 1895 году, в её нижнем этаже в 1902 году освятили храм в честь Иверской иконы Божией Матери.
В 1918 году собственность прихода была отобрана советскими властями, в 1929 году храм закрыли. Его здание передали под общежитие Планового (экономического) института, в колокольне разместили детский сад. В 1931 году храм попытались взорвать, но безуспешно, с колокольни и церкви были сняты купола. В 1970-х годах в соборе были размещены мастерские местных художников.
В январе 1992 года храм передали Русской православной церкви, первая литургия прошла 18 апреля. В 1998-2004 годах колокольню восстановили, её общая высота со шпилем равна 66 метрам.
Сейчас при храме работают библиотека и церковно-приходская воскресная школа. Добраться до Покровского собора можно на автобусах №№2Д и 33, маршрутных такси №№8, 9, 72, 73, 83, 94.