В 1700-1718 годах в Муроме была построена каменная Николо-Набережная церковь, построенная на месте деревянной. Во время разливов Оки вода доходила до стен храма, поэтому в народе его называли «церковью Николы Мокрого». В XVII веке на этом месте располагался деревянный путевой дворец, построенный для Ивана Грозного. Здание было разобрано в 1630-х годах.
В 1803 году к храму была пристроена трапезная, в 1847 году — Власьевский придел. Во второй половине XIX столетия возле церкви была сооружена терраса с оградой.
В 1940 году Николо-Набережную церковь закрыли, и до 1960-х годов в ней работала птицефабрика. Потом храм передали городскому музею, который хранил здесь свои коллекции. В 1991 году здание вернули верующим для возобновления богослужений.
