В 1743 году на этом месте началось строительство часовни Непорочного зачатия по проекту архитекторов Жозефа Гомбера и Доминика Делессаля. Работы завершились в 1748 году, и тогда же часовня была освящена. В течение нескольких лет ею управляли иезуиты.
В конце XVIII века лилльская церковь святого Стефана сгорела, и было решено переименовать в её честь часовню Непорочного зачатия, придав ей статус храма. Более 30 окон церкви украшены витражными картинами Шарля Годеле. В самой церкви можно увидеть живописные произведения, скульптуры и предметы утвари. В 1980-х годах храм получил статус исторического памятника.