Победителем конкурса на проектирование часовни в Вологде стал архитектор Герман Виноградов, обошедший десятерых других претендентов. Здание заложили в Рождество Христово, 7 января 2001 года в парке ВРЗ.
На одной, не сквозной стене, размещено мозаичное изображение Владимирской Божией Матери. Вход украшают кованые решётки, автором эскизов которых стал архитектор Александр Борисовский. Он же спроектировал крест, который был выполнен методом горячей ковки с элементами декоративной чеканки.
Часовню строили на пожертвования вологжан, местных организаций и предприятий, храмов епархии. Её освятили 7 июля 2002 года, положив в нише бетонной скамейки металлическую капсулу с именами всех жертвователей. В настоящее время часовня относится к Покровскому Архиерейскому подворью. В нескольких метрах от неё расположен Вологодский кремль.