В 1716-1723 годах в Белозерске была выстроена церковь Всемилостивого Спаса. Другие её названия — «Спас на канале» и «Спас под горою».
В храме было несколько приделов — Сретенский, Екатерининский, Андреевский и Димитриевский. Пожар 1753 года уничтожил иконостас и внутреннее убранство. Два года спустя храм был отремонтирован и в таком виде дошёл до наших дней.
В 1930-х годах Спасскую церковь закрыли, использовал как спортивный зал. Некоторое время она находилась в ведении местного музея. На рубеже 1980-1990-х годов московский отряд «РеставросЪ» отвёл грунтовые воды от фундамента храма, восстановил каменный декор, кованые решётки и оконные проёмы.
В рамках ремонтно-реставрационных работ 2011-2012 годов удалось расчистить и оштукатурить стены, сохранив фрагменты оригинальных фресок и лепнину. Первый после реставрации молебен был проведён в августе 2012 года. Сейчас Спасский храм в Белозерске является действующим, он признан памятником архитектуры федерального значения.