Нижегородская церковь Ильи Пророка известна с XVI века. Согласно легенде, на этом месте в 1505 году при осаде города был убит ногайский мурза. Вслед за этим событием среди татар и ногайцев началась распря, приведшая к снятию осады. В память об избавлении от врагов здесь поставили церковь в честь пророка Ильи, который считался покровителем «огненных бойцов».
В XVII веке была построена каменная церковь типа «корабль». В 1874 году здание подверглось перестройке, в результате которой были укреплены фундаменты, расширена трапезная и сооружено пятиглавие. В 1977-1994 годах здесь размещалась хлебопекарня. В 1995 году храм вернули верующим, после чего он подвергся реставрации.
