Богоявленскую церковь, или Никольскую, как её называют в народе,начали строить в 1710 году по проекту местного архитектора С.А. Воротилова. Семь лет спустя освятили Никольский придел, ещё через восемь лет — саму церковь. В первой половине ХIХ века храм расширили за счёт пристройки трапезной, в конце столетия — благодаря сооружению ризницы и библиотеки.
В 1930-х годах храм лишили куполов, были сломаны колокольня, апсиды и ограда. Разрушенное удалось восстановить в 1980-х годах, автором проекта стал архитектор А.П. Чернов.
В интерьере Богоявленского собора уцелели настенные росписи, которые артель ярославских художников создавала в 1768-1769 годах. В 1987 году в храме поместили три иконостаса 1776 года, которые привезли из села Верховье Солигаличского района Костромской области.
В Богоявленской церкви раньше работал краеведческий музей, теперь его экспонаты перенесли в здание Брюхановской больницы. Сейчас происходит передача здания Костромской епархии Русской православной церкви.
